Αναλυτικά το πρόγραμμα των «πρασίνων»:
1η αγωνιστική
4/10 Παναθηναϊκός – Ερυθρός Αστέρας
2η αγωνιστική
10/10 Βιλερμπάν – Παναθηναϊκός
3η αγωνιστική
17/10 Παναθηναϊκός – Αρμάνια Μιλάνο
4η αγωνιστική
24/10 Ζενίτ Αγίας Πετρούπολης – Παναθηναϊκός
5η αγωνιστική
29/10 Χίμκι – Παναθηναϊκός
6η αγωνιστική
31/10 Παναθηναϊκός – Αναντολού Εφές
7η αγωνιστική
8/11 Παναθηναϊκός – Βαλένθια
8η αγωνιστική
14/11 Παναθηναϊκός – Άλμπα Βερολίνου
9η αγωνιστική
19/11 Ζάλγκιρις Κάουνας – Παναθηναϊκός
10η αγωνιστική
22/11 Μπάγερν Μονάχου – Παναθηναϊκός
11η αγωνιστική
28/11 Παναθηναϊκός – Μπασκόνια
12η αγωνιστική
6/12 Παναθηναϊκός – Ολυμπιακός
13η αγωνιστική
13/12 Μπαρτσελόνα – Παναθηναϊκός
14η αγωνιστική
17/12 Παναθηναϊκός – Φενέρμπαχτσε
15η αγωνιστική
19/12 Μακάμπι Τελ Αβίβ – Παναθηναϊκός
16η αγωνιστική
26/12 Παναθηναϊκός – Ρεάλ Μαδρίτης
17η αγωνιστική
2/1 ΤΣΣΚΑ Μόσχας – Παναθηναϊκός
18η αγωνιστική
9/1 Αρμάνι Μιλάνο – Παναθηναϊκός
19η αγωνιστική
15/1 Παναθηναϊκός – Μπάγερν Μονάχου
20η αγωνιστική
17/1 Παναθηναϊκός – Ζάλγκιρις
21η αγωνιστική
24/1 Παναθηναϊκός – Βιλερμπάν
22η αγωνιστική
31/1 Βαλένθια – Παναθηναϊκός
23η αγωνιστική
5/2 Ερυθρός Αστέρας – Παναθηναϊκός
24η αγωνιστική
7/2 Παναθηναϊκός – Ζενίτ Αγίας Πετρούπολης
25η αγωνιστική
21/2 Παναθηναϊκός – Μπαρτσελόνα
26η αγωνιστική
28/2 Ρεάλ Μαδρίτης – Παναθηναϊκός
27η αγωνιστική
3/3 Ολυμπιακός – Παναθηναϊκός
28η αγωνιστική
5/3 Παναθηναϊκός – ΤΣΣΚΑ Μόσχας
29η αγωνιστική
13/3 Φενέρμπαχτσε – Παναθηναϊκός
30η αγωνιστική
19/3 Άλμπα Βερολίνου – Παναθηναϊκός
31η αγωνιστική
25/3 Παναθηναϊκός – Χίμκι
32η αγωνιστική
27/3 Αναντολού Εφές – Παναθηναϊκός
33η αγωνιστική
3/4 Παναθηναϊκός – Μακάμπι Τελ Αβίβ
34η αγωνιστική
10/4 Μπασκόνια – Παναθηναϊκός